Флагманский корабль — корабль, на котором находятся командир или командующий соединения или объединения, (управление (штаб, службы и так далее)) и флагманский командный пункт (ФКП), оборудованный средствами управления.
На ФКП развёртываются штабные посты, находятся офицеры связи взаимодействующих соединений и частей (кораблей) флота (флотилии), сухопутных войск и авиации. Флагманский корабль носит флаг, присвоенный командиру данного соединения или объединения. В ночное время флагманский корабль носит флагманский огонь.
ВМФ России состоит из оперативно-стратегических объединений - Балтийского, Северного, Черноморского, Тихоокеанского флотов и Каспийской флотилии. У каждого из флотов есть свои флагманские корабли - на которых находится командующий и командный пункт.
