В первой половине XVII века Печатный двор в Москве существовал на средства казны и назывался Государевым печатным двором. Издание всех книг всегда происходило только по указу царя. В этот период одной из главных задач одного из отделений Печатного двора было обеспечение книгами школы, основанной патриархом Филаретом. Отделение под руководством Василия Бурцова-Протопопова выпускало помимо религиозной литературы буквари для начального обучения чтению. Во второй половине века Печатный двор был передан в ведение духовенства. С этого момента патриарх Никон стал распорядителем печати и имел право самостоятельно издавать указы о создании новых книг. В основной своей части Печатный двор занимался выпуском религиозных изданий и летописей.
За время существования Печатного двора были изданы такие книги, как Триодь постная, Триодь цветная, Евангелия, Псалтырь, Часовник и другие. В целом с 1564 по 1711 год было отпечатано около 700 изданий, среди которых были так называемые четьи книги, полемические сочинения, переводы, учебная литература.
